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苹果手机短信消失可能有以下几种原因。
1、可能是不小心开启了短信的自动删除模式，尝试在设置中找到短信选项并查看是否开启了删除模式，如果开启了，可以关闭该模式，也可以检查短信是否已过期或存储空间已满，这可能导致短信被自动删除。
2、如果手机还原了出厂设置或者删除了某些重要数据，也可能导致短信消失，此时可以尝试连接iTunes进行恢复，如果手机存在系统问题或硬件故障，也可能导致短信消失，在这种情况下，可能需要联系苹果官方客服进行维修或更换设备。
只是一些可能的原因和解决方法，如果短信仍然无法恢复，建议联系苹果官方客服寻求进一步的帮助。